Het werkingsprincipe van een stofafscheider in een filterhuis kan worden onderverdeeld in drie hoofdfasen: filtratie, reiniging en stofafvoer.
1. Filtratiefase: Nadat met stof-beladen gas de stofafscheider binnenkomt via de inlaat, nestelen grote stofdeeltjes zich eerst in de stofvergaarbak vanwege de lagere luchtstroomsnelheid en de werking van de geleideplaten. Fijne stofdeeltjes stijgen op met de luchtstroom en worden tijdens het passeren op het oppervlak van de filterzakken opgevangen. Het gezuiverde gas wordt uit de binnenkant van de filterzakken afgevoerd en komt via de uitlaat in de atmosfeer terecht.
2. Reinigingsfase: Naarmate stof zich ophoopt op het oppervlak van de filterzakken, neemt de luchtdoorlaatbaarheid van de filterzakken geleidelijk af en neemt de weerstand van de stofafscheider toe. Wanneer de weerstand een ingestelde waarde bereikt, wordt het reinigingssysteem geactiveerd. Als we bijvoorbeeld de pulsjetreiniging nemen, wordt er via de straalpijp onmiddellijk perslucht in de binnenkant van de filterzakken geïnjecteerd, waardoor de filterzakken snel uitzetten. De stoflaag valt er onder traagheid af en valt in de stoftrechter.
3. Stofafvoerfase: Het gevallen stof wordt afgevoerd via het stofafvoerapparaat aan de onderkant van de stofcontainer, dat handmatig of automatisch kan worden bediend. De asafvoerfrequentie moet worden aangepast aan de stofophopingssnelheid om de normale werking van de stofafscheider te garanderen.